Plancia di Comando La Nautilus è equipaggiata con una plancia appositamente progettata e realizzata per affrontare situazioni di battaglia, attraverso sistemi di controllo "ship-wide". La plancia della Nautilus contiene le console di controllo standard delle navi stellari della Federazione con l'aggiunta di una serie stazioni di controllo e di sistemi tattici rindondanti multipli che permette in questo modo di aumentare le capacità di controllo dei sistemi da parte dell'equipaggio. Ad aggiunta di queste peculiarità vi è anche un sistema di controllo generale a "piano" che permette all'equipaggio di pianificare in maniera accurata e completa ogni strategia e ogni situazione tattica, in modo da ridimensionare e ridurre i tempi di intervento dell'equipaggio sui vari sistemi. La stazione di controllo Ingegneria e la console scientifica sono state incluse nel ponte che originariamente non erano state previste, e potenziate attraverso una serie di collegamenti ODN su linee dedicate al computer principale e a tutti i sistemi critici della nave, che risultano essere assolutamente vitali alle operazioni della nave durante una battaglia. Diversamente dalle altre navi Federali, la Nautilus come tutte le navi di classe Defiant dispone di un'unica postazione e console che permette all'operatore di svolgere le funzioni di Navigatore e Addetto Operazioni (CONN e OPS). Precedentemente invece le navi stellari federali disponevano per il controllo della nave di una console dedicata al Navigatore e una al Timoniere. Questa sistema a console singola rappresenta un efficace aggiornamento nei sistemi di controllo timone e navigazione assistiti dal computer. Cliccare sull'immagine dello schema del ponte di comando per ingrandire lo schema in finestra ed avere informazioni dettagliate sulle varie postazioni.